MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	283782521
2	NC_013721	ATT	2	6	46	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782521
3	NC_013721	GC	3	6	91	96	0 %	0 %	50 %	50 %	283782521
4	NC_013721	CGAT	2	8	111	118	25 %	25 %	25 %	25 %	283782521
5	NC_013721	AAT	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
6	NC_013721	CTAC	2	8	214	221	25 %	25 %	0 %	50 %	283782521
7	NC_013721	AT	3	6	226	231	50 %	50 %	0 %	0 %	283782521
8	NC_013721	ACG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782521
9	NC_013721	TCT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
10	NC_013721	AAG	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782521
11	NC_013721	AC	3	6	441	446	50 %	0 %	0 %	50 %	283782521
12	NC_013721	TCT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
13	NC_013721	AAGT	2	8	597	604	50 %	25 %	25 %	0 %	283782521
14	NC_013721	AC	3	6	623	628	50 %	0 %	0 %	50 %	283782521
15	NC_013721	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782521
16	NC_013721	TCT	2	6	655	660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
17	NC_013721	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
18	NC_013721	TCCC	2	8	727	734	0 %	25 %	0 %	75 %	283782521
19	NC_013721	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	283782521
20	NC_013721	GA	3	6	830	835	50 %	0 %	50 %	0 %	283782521
21	NC_013721	GCC	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782521
22	NC_013721	CTTC	2	8	865	872	0 %	50 %	0 %	50 %	283782521
23	NC_013721	ATT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
24	NC_013721	GCA	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
25	NC_013721	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
26	NC_013721	TAA	2	6	1111	1116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
27	NC_013721	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
28	NC_013721	GA	3	6	1133	1138	50 %	0 %	50 %	0 %	283782522
29	NC_013721	ATT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
30	NC_013721	CAA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
31	NC_013721	TCA	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
32	NC_013721	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
33	NC_013721	TAC	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
34	NC_013721	GCA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
35	NC_013721	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
36	NC_013721	ACC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782522
37	NC_013721	AGC	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
38	NC_013721	CCG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
39	NC_013721	CAA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
40	NC_013721	ACA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
41	NC_013721	TCT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
42	NC_013721	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
43	NC_013721	CGAG	2	8	1660	1667	25 %	0 %	50 %	25 %	283782522
44	NC_013721	CTG	2	6	1726	1731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
45	NC_013721	GAT	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
46	NC_013721	GCA	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
47	NC_013721	AGC	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
48	NC_013721	CCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
49	NC_013721	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	283782522
50	NC_013721	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782522
51	NC_013721	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
52	NC_013721	GGA	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782522
53	NC_013721	CTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
54	NC_013721	CTT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
55	NC_013721	TAA	2	6	2158	2163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
56	NC_013721	ATGT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	25 %	0 %	283782522
57	NC_013721	TG	3	6	2236	2241	0 %	50 %	50 %	0 %	283782522
58	NC_013721	TCA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
59	NC_013721	ATT	3	9	2450	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
60	NC_013721	CTT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
61	NC_013721	T	6	6	2577	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	283782522
62	NC_013721	ATG	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
63	NC_013721	CAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
64	NC_013721	TTC	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782523
65	NC_013721	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
66	NC_013721	AGC	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782523
67	NC_013721	TCG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
68	NC_013721	TACTT	2	10	3042	3051	20 %	60 %	0 %	20 %	283782523
69	NC_013721	CATGC	2	10	3073	3082	20 %	20 %	20 %	40 %	283782523
70	NC_013721	AGA	3	9	3208	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
71	NC_013721	ACTT	2	8	3248	3255	25 %	50 %	0 %	25 %	283782523
72	NC_013721	CAA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782523
73	NC_013721	GAA	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
74	NC_013721	TG	3	6	3303	3308	0 %	50 %	50 %	0 %	283782523
75	NC_013721	ATGC	2	8	3714	3721	25 %	25 %	25 %	25 %	283782524
76	NC_013721	CAA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
77	NC_013721	CTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782524
78	NC_013721	AAG	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782524
79	NC_013721	TACACT	2	12	3937	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782524
80	NC_013721	TTA	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782524
81	NC_013721	ATG	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
82	NC_013721	CGATGG	2	12	4002	4013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283782524
83	NC_013721	GAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
84	NC_013721	ATAA	2	8	4111	4118	75 %	25 %	0 %	0 %	283782524
85	NC_013721	GGA	2	6	4234	4239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
86	NC_013721	TGTTT	2	10	4248	4257	0 %	80 %	20 %	0 %	283782524
87	NC_013721	GAT	3	9	4342	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
88	NC_013721	TTGA	2	8	4402	4409	25 %	50 %	25 %	0 %	283782524
89	NC_013721	GGA	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
90	NC_013721	AAAGGC	2	12	4501	4512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283782524
91	NC_013721	ATTCA	2	10	4539	4548	40 %	40 %	0 %	20 %	283782524
92	NC_013721	GTTG	2	8	4577	4584	0 %	50 %	50 %	0 %	283782524
93	NC_013721	TGGA	2	8	4810	4817	25 %	25 %	50 %	0 %	283782524
94	NC_013721	AAC	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
95	NC_013721	AGTA	2	8	5208	5215	50 %	25 %	25 %	0 %	283782525
96	NC_013721	CA	3	6	5221	5226	50 %	0 %	0 %	50 %	283782525
97	NC_013721	CAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
98	NC_013721	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
99	NC_013721	GATT	2	8	5394	5401	25 %	50 %	25 %	0 %	283782525
100	NC_013721	GCGACG	2	12	5444	5455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283782525
101	NC_013721	GAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
102	NC_013721	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
103	NC_013721	TTA	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
104	NC_013721	CGACGG	2	12	5544	5555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283782525
105	NC_013721	AAG	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
106	NC_013721	ACT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782525
107	NC_013721	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
108	NC_013721	TTA	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
109	NC_013721	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
110	NC_013721	CTTG	2	8	5898	5905	0 %	50 %	25 %	25 %	283782525
111	NC_013721	GCT	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782525
112	NC_013721	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
113	NC_013721	AGT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
114	NC_013721	AT	3	6	6110	6115	50 %	50 %	0 %	0 %	283782525
115	NC_013721	ACTA	2	8	6156	6163	50 %	25 %	0 %	25 %	283782525
116	NC_013721	AAG	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
117	NC_013721	GAAT	2	8	6293	6300	50 %	25 %	25 %	0 %	283782525
118	NC_013721	TTA	2	6	6392	6397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
119	NC_013721	CAA	2	6	6473	6478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
120	NC_013721	TCT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782525
121	NC_013721	TAC	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782525
122	NC_013721	TAT	2	6	6621	6626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
123	NC_013721	CTG	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782525
124	NC_013721	A	6	6	6712	6717	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
125	NC_013721	A	6	6	6759	6764	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
126	NC_013721	AAC	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
127	NC_013721	ACA	2	6	6808	6813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
128	NC_013721	ACA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
129	NC_013721	CAAA	2	8	6854	6861	75 %	0 %	0 %	25 %	283782525
130	NC_013721	CGCCTT	2	12	7064	7075	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	283782525
131	NC_013721	CAA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
132	NC_013721	AAACC	2	10	7129	7138	60 %	0 %	0 %	40 %	283782525
133	NC_013721	CCA	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782525
134	NC_013721	ACA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
135	NC_013721	TAA	2	6	7287	7292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
136	NC_013721	CA	4	8	7430	7437	50 %	0 %	0 %	50 %	283782525
137	NC_013721	AAT	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
138	NC_013721	A	6	6	7539	7544	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
139	NC_013721	AT	3	6	7630	7635	50 %	50 %	0 %	0 %	283782525
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144	NC_013721	AAT	2	6	7849	7854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
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264	NC_013721	GAA	2	6	15305	15310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782531
265	NC_013721	CAT	2	6	15437	15442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782531
266	NC_013721	CTT	2	6	15503	15508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782531
267	NC_013721	CAA	2	6	15566	15571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782531
268	NC_013721	CAT	2	6	15593	15598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782531
269	NC_013721	TTC	2	6	15657	15662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782531
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280	NC_013721	GCA	2	6	16583	16588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782532
281	NC_013721	ATC	4	12	16621	16632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782532
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286	NC_013721	GCA	2	6	16844	16849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782532
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387	NC_013721	ACA	2	6	22087	22092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782536
388	NC_013721	CAA	2	6	22097	22102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782536
389	NC_013721	TGCGAT	2	12	22104	22115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283782536
390	NC_013721	TGC	2	6	22244	22249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782536
391	NC_013721	TAT	3	9	22259	22267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782536
392	NC_013721	CGTG	2	8	22358	22365	0 %	25 %	50 %	25 %	283782536
393	NC_013721	GCT	2	6	22539	22544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782536
394	NC_013721	GAC	2	6	22581	22586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782536
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396	NC_013721	CTA	2	6	22630	22635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782536
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399	NC_013721	A	7	7	22670	22676	100 %	0 %	0 %	0 %	283782536
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403	NC_013721	TTGC	2	8	22876	22883	0 %	50 %	25 %	25 %	283782536
404	NC_013721	CTTG	2	8	22898	22905	0 %	50 %	25 %	25 %	283782536
405	NC_013721	GCG	2	6	22906	22911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782536
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412	NC_013721	TAT	2	6	23216	23221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782536
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